Я так понимаю логику этих людей на местах: увидят власти, что врачи из поликлиники №42 проголосовали против, придут выяснять к начальству, почему плохо работают с персоналом. То есть для них есть разница между тайным голосованием в оффлайне и потенциально не-тайным дистанционным.
Не уверен, что это разумные предположения людей на местах, но думаю, что логика такая.
Все проще. Я думаю, эта разнарядка связана с тем, чтобы именно по электронному голосованию был максимальный процент голосов "за", иначе эту систему ЦИКу не "продать" - если система спроектирована грамотно, то влиять на результаты голосования путем переписывания протоколов, как это сейчас делается, станет невозможно, чего в Центризбиркоме, скорее всего, дико опасаются.